Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brpf3B2KF05 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brpf3B2KF05 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms