Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scn7aB1AYL1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms