Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd60A2AMD2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms