Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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