Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Knop1Q9Z2Q2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms