Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stk39Q9Z1W9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stk39Q9Z1W9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stk39Q9Z1W9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms