Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z126

Pf4, Platelet factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pf4Q9Z126 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pf4Q9Z126 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pf4Q9Z126 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pf4Q9Z126 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pf4Q9Z126 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pf4Q9Z126 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pf4Q9Z126 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pf4Q9Z126 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pf4Q9Z126 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pf4Q9Z126 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pf4Q9Z126 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pf4Q9Z126 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pf4Q9Z126 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pf4Q9Z126 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pf4Q9Z126 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pf4Q9Z126 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pf4Q9Z126 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pf4Q9Z126 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pf4Q9Z126 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pf4Q9Z126 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms