Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AireQ9Z0E3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AireQ9Z0E3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AireQ9Z0E3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AireQ9Z0E3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AireQ9Z0E3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AireQ9Z0E3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AireQ9Z0E3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AireQ9Z0E3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AireQ9Z0E3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AireQ9Z0E3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AireQ9Z0E3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AireQ9Z0E3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AireQ9Z0E3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
AireQ9Z0E3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AireQ9Z0E3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AireQ9Z0E3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AireQ9Z0E3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AireQ9Z0E3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AireQ9Z0E3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AireQ9Z0E3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AireQ9Z0E3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AireQ9Z0E3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AireQ9Z0E3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AireQ9Z0E3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AireQ9Z0E3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AireQ9Z0E3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AireQ9Z0E3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AireQ9Z0E3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AireQ9Z0E3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AireQ9Z0E3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AireQ9Z0E3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AireQ9Z0E3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms