Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme3Q9WV85 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.9 ms