Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syt6Q9R0N8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms