Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms