Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh2d3cQ9QZS8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh2d3cQ9QZS8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms