Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc3Q9QZC1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc3Q9QZC1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc3Q9QZC1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc3Q9QZC1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc3Q9QZC1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc3Q9QZC1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc3Q9QZC1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc3Q9QZC1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc3Q9QZC1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc3Q9QZC1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc3Q9QZC1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc3Q9QZC1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc3Q9QZC1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc3Q9QZC1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc3Q9QZC1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms