Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms