Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SpastQ9QYY8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SpastQ9QYY8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpastQ9QYY8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms