Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms