Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Txnrd1Q9JMH6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Txnrd1Q9JMH6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms