Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmgn5Q9JL35 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms