Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.6 ms