Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc12a4Q9JIS8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc12a4Q9JIS8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms