Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERV1

Mkrn2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn2Q9ERV1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn2Q9ERV1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mkrn2Q9ERV1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mkrn2Q9ERV1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mkrn2Q9ERV1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mkrn2Q9ERV1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn2Q9ERV1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn2Q9ERV1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn2Q9ERV1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn2Q9ERV1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn2Q9ERV1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn2Q9ERV1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn2Q9ERV1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn2Q9ERV1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn2Q9ERV1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms