Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfcp2Q9ERA0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.7 ms