Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER58

Spock2, Testican-2, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock2Q9ER58 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spock2Q9ER58 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spock2Q9ER58 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Spock2Q9ER58 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spock2Q9ER58 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spock2Q9ER58 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spock2Q9ER58 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spock2Q9ER58 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spock2Q9ER58 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spock2Q9ER58 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spock2Q9ER58 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spock2Q9ER58 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spock2Q9ER58 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spock2Q9ER58 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spock2Q9ER58 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spock2Q9ER58 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spock2Q9ER58 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spock2Q9ER58 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spock2Q9ER58 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms