Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Stx12Q9ER00 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms