Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Swt1Q9DBQ9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Swt1Q9DBQ9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms