Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SrpraQ9DBG7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrpraQ9DBG7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms