Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slx4ipQ9D7Y9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slx4ipQ9D7Y9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slx4ipQ9D7Y9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slx4ipQ9D7Y9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slx4ipQ9D7Y9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms