Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W5

Med8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med8Q9D7W5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med8Q9D7W5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Med8Q9D7W5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med8Q9D7W5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med8Q9D7W5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med8Q9D7W5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med8Q9D7W5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med8Q9D7W5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med8Q9D7W5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med8Q9D7W5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med8Q9D7W5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med8Q9D7W5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med8Q9D7W5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med8Q9D7W5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med8Q9D7W5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med8Q9D7W5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Med8Q9D7W5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med8Q9D7W5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med8Q9D7W5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Med8Q9D7W5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med8Q9D7W5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms