Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt34Q9D646 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt34Q9D646 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms