Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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