Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chordc1Q9D1P4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms