Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prpsap1Q9D0M1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpsap1Q9D0M1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms