Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx17Q9D0I4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx17Q9D0I4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx17Q9D0I4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx17Q9D0I4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms