Protein–RNA interactions for Protein: Q9D061

Acbd6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd6Q9D061 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.7 ms