Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa9Q9CZN4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms