Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem50aQ9CXL1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem50aQ9CXL1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem50aQ9CXL1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem50aQ9CXL1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem50aQ9CXL1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms