Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.9 ms