Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRD2

Emc2, ER membrane protein complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc2Q9CRD2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Emc2Q9CRD2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Emc2Q9CRD2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Emc2Q9CRD2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Emc2Q9CRD2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Emc2Q9CRD2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Emc2Q9CRD2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emc2Q9CRD2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Emc2Q9CRD2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms