Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc96Q9CR92 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms