Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd1Q9CR42 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd1Q9CR42 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd1Q9CR42 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd1Q9CR42 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd1Q9CR42 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd1Q9CR42 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd1Q9CR42 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd1Q9CR42 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd1Q9CR42 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd1Q9CR42 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd1Q9CR42 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd1Q9CR42 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd1Q9CR42 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd1Q9CR42 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd1Q9CR42 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd1Q9CR42 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd1Q9CR42 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ankrd1Q9CR42 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms