Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms