Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mid1ip1Q9CQ20 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms