Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms