Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim11Q99PQ2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trim11Q99PQ2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms