Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn6Q99PL6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn6Q99PL6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms