Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcf2Q99LE6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Abcf2Q99LE6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms