Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TriobpQ99KW3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms