Protein–RNA interactions for Protein: Q924N4

Slc12a6, Solute carrier family 12 member 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a6Q924N4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc12a6Q924N4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc12a6Q924N4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc12a6Q924N4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc12a6Q924N4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc12a6Q924N4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc12a6Q924N4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a6Q924N4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc12a6Q924N4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms