Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf3Q922U1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf3Q922U1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms