Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cts3Q91ZD5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cts3Q91ZD5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms